前期准备与体系策划
企业需明确认证决心，成立专项小组，开展全员培训。依据企业实际确定管理范围、方针和目标，编制职业健康安全管理手册、程序文件等体系文件。例如，麦当劳(马来西亚)在认证前，对全体员工进行了职业健康安全培训，确保员工了解并遵守相关政策。
风险评估与控制措施制定
识别工作场所的潜在危险源(如设备隐患、化学物质暴露等)，评估风险等级，制定控制措施(如工程改进、防护装备配备)。荷兰国家铁路公司(NS)通过风险评估，优化了列车乘务员的工作流程，降低了职业伤害风险。
体系运行与内部审核
严格执行体系文件要求，定期开展内部审核，确保职业健康安全管理体系的有效性。诺基亚在全球范围内建立了统一的职业健康与安全标准，通过内部审核和持续改进，提高了员工的安全意识和生产效率。
管理评审与持续改进
高层管理者对体系进行系统评价，提出改进建议并检查改进效果。新加坡国立大学医院通过管理评审，不断优化职业健康安全管理体系，为员工提供了更安全健康的工作环境。
认证申请与审核
向认证机构提交申请，经文件审核与现场审核，合格后获取认证证书。认证机构会评估组织的要求和/或文件，通过面谈以及在客户场所进行现场检查的形式，验证ISO45001的要求是否已得到有效执行。
监督审核与证书维护
认证证书有效期为3年，企业需接受认证机构的监督审核(一般每12个月一次)。逾期不年审或换证，证书将过期或失效。